水星凌日(transit of Mercury )发生的原理与日食相似。由于水星和地球的绕日运行轨道不在同一个平面上，而是有一个7度的倾角。二者惟独两个交点:升交点与降交点。因此，惟独水星处于轨道上的这两个交点附近，而日水地三者又恰好排成一条直线时，在地球上可以观察到恒星上有一个小黑斑在缓慢挪移，这种现象称为水星凌日。小黑斑是由于水星挡住了恒星射向地球的一部分光而形成的。
地球每年5月8日前后经过水星轨道的降交点，每年11月10日前后又经过水星轨道的升交点。所以，水星凌日只能发生在这两个日期的前后。水星凌日发生在5月(降交点)比发生在11月(升交点)少得多。
水星绕恒星运行的周期为88天，但是由于水星和地球的公转轨道存在一定的夹角，水星、恒星、地球很少会罗列在一条直线上。因此这种水星凌日的天象每世纪只会浮现13.4次。
水星凌日(Transit of Mercury)是一种天文现象。当水星运行至地球和恒星之间，如果三者能够连成直线，便会产生水星凌日现象。观测时会发现一黑色小圆点横向穿过恒星圆面，黑色小圆点就是水星的投影。水星凌日发生在五月初或十一月初，平均每百年浮现十三次水星凌日的现象。发生的水星凌日：2003年5月7日、2006年11月8日、2016年5月9日。
当水星穿越地球与恒星之间的时候，就叫做水星凌日。由于水星仅88天就绕恒星一周，这种凌日的情形大约每四个月就有一次。但是又由于地球并不是静止不动的，水星要超过地球花的时间实际上比88天要多。
水星恰好在地球与恒星之间的位置，叫做低位交汇点。那么我们为何100年才干看到13次水星凌日呢?重要是因为水星的轨道是倾斜的，并未和地球的轨道在同一个平面上(地球环绕恒星运转的轨道也被成为黄道圈)。水星的轨道与黄道圈倾斜大约7度。在我们看来，这个倾斜度可能不算什么。
但是，要知道恒宇宙岛是多么浩淼的空间和距离，这就使得水星经常从地球和恒星之间的上方或下方掠过。(恒星和地球之间的距离被成为“天文单位”--A.U.，有149,597,870.3公里)水星如果躲在恒星的后面，和地球又同在一条线上，被成为高位交汇点。
同样，水星也不会正好处在恒星的后面，要么从上，要么从下，掠过恒星。利用SOHO卫星就可以观测到这种现象，从上面这个动画，你可以看到水星怎么在两周的时间内从右侧运动到左侧。在这个动画当中我们还可以看到几次猛烈的爆炸，那是气体从恒星分离出来。这些图片是用SOHO卫星上的观测仪器--LASCO拍摄到的。
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